Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.28□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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PKHD1P08F94 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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PKHD1P08F94 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
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PKHD1P08F94 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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PKHD1P08F94 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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