Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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