Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
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