Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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