Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBM17Q96I25 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.9 ms