Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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