Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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CDO1Q16878 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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CDO1Q16878 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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CDO1Q16878 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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CDO1Q16878 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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