Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms