Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PKN1Q16512 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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