Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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SNCBQ16143 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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SNCBQ16143 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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SNCBQ16143 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
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SNCBQ16143 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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SNCBQ16143 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
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SNCBQ16143 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
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SNCBQ16143 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
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SNCBQ16143 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
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SNCBQ16143 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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