Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1AQ15573 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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