Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SS18Q15532 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SS18Q15532 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SS18Q15532 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SS18Q15532 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SS18Q15532 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SS18Q15532 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SS18Q15532 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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