Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
NCAPHQ15003 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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