Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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NR1I3Q14994 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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NR1I3Q14994 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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NR1I3Q14994 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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NR1I3Q14994 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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NR1I3Q14994 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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NR1I3Q14994 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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NR1I3Q14994 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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NR1I3Q14994 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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NR1I3Q14994 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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NR1I3Q14994 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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NR1I3Q14994 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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NR1I3Q14994 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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NR1I3Q14994 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1I3Q14994 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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