Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
DSC3Q14574 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DSC3Q14574 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms