Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN5AQ14524 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN5AQ14524 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN5AQ14524 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN5AQ14524 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN5AQ14524 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
SCN5AQ14524 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SCN5AQ14524 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN5AQ14524 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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