Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSHL1Q14406 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSHL1Q14406 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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