Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms