Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
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