Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCINQ13939 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCINQ13939 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms