Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms