Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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