Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL4BQ13620 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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