Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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