Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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