Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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FOXE3Q13461 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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FOXE3Q13461 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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FOXE3Q13461 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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FOXE3Q13461 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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FOXE3Q13461 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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FOXE3Q13461 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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FOXE3Q13461 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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FOXE3Q13461 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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FOXE3Q13461 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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FOXE3Q13461 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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FOXE3Q13461 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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FOXE3Q13461 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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