Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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SF3B2Q13435 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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