Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
AP3B2Q13367 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms