Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms