Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRDM2Q13029 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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