Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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NFIAQ12857 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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