Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms