Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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GTF3C1Q12789 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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GTF3C1Q12789 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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