Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.86□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC-0.86□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC-0.89□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CENPEQ02224 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms