Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPREP23469 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPREP23469 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPREP23469 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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