Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTIFO43310 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTIFO43310 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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