Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28O15084 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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