Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C4orf47A7E2U8 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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