Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX15Q9NRS6 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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