Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms