Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ATG16L1Q676U5 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATG16L1Q676U5 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.7 ms