Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
C9orf135Q5VTT2 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms