Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
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LAMA3Q16787 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
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LAMA3Q16787 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
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LAMA3Q16787 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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