Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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