Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXD1Q16676 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.3 ms