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| FXN | Q16595 | KNTC1-201 | ENST00000333479 | 6975 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
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| FXN | Q16595 | DOCK7-218 | ENST00000635123 | 6297 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| FXN | Q16595 | PPIP5K2-217 | ENST00000627916 | 6010 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| FXN | Q16595 | RNU6-379P-201 | ENST00000363813 | 104 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| FXN | Q16595 | AP002088.1-201 | ENST00000382740 | 395 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| FXN | Q16595 | MIR29B2-201 | ENST00000385055 | 81 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
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| FXN | Q16595 | ACTG1P17-203 | ENST00000561222 | 537 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
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| FXN | Q16595 | MIR5006-201 | ENST00000583027 | 110 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| FXN | Q16595 | AC011373.1-201 | ENST00000607270 | 237 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
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| FXN | Q16595 | SDR42E1P4-201 | ENST00000620894 | 481 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| FXN | Q16595 | ADGRG2-206 | ENST00000360279 | 4702 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| FXN | Q16595 | C18orf54-202 | ENST00000382911 | 4056 nt | TSL 5 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| FXN | Q16595 | MYOT-208 | ENST00000515645 | 1578 nt | TSL 2 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| FXN | Q16595 | AP003122.5-201 | ENST00000527668 | 3766 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
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| FXN | Q16595 | MDM2-206 | ENST00000350057 | 1401 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| FXN | Q16595 | Y_RNA.237-201 | ENST00000364439 | 102 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
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| FXN | Q16595 | Y_RNA.477-201 | ENST00000384352 | 108 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
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| FXN | Q16595 | Y_RNA.518-201 | ENST00000384552 | 113 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
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| FXN | Q16595 | RNU6-625P-201 | ENST00000459412 | 107 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
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| FXN | Q16595 | RNU6-496P-201 | ENST00000516145 | 99 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| FXN | Q16595 | RNU2-44P-201 | ENST00000516795 | 194 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| FXN | Q16595 | RNU7-110P-201 | ENST00000516891 | 62 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| FXN | Q16595 | DEFB108E-201 | ENST00000524692 | 240 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| FXN | Q16595 | DEFB131C-201 | ENST00000528817 | 165 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| FXN | Q16595 | AC018448.1-201 | ENST00000552843 | 316 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
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| FXN | Q16595 | AC012433.1-201 | ENST00000588916 | 398 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
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| FXN | Q16595 | AL807742.1-203 | ENST00000637444 | 759 nt | TSL 5 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |