Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
ACKR1Q16570 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ACKR1Q16570 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ACKR1Q16570 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ACKR1Q16570 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACKR1Q16570 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACKR1Q16570 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACKR1Q16570 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACKR1Q16570 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACKR1Q16570 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACKR1Q16570 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACKR1Q16570 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACKR1Q16570 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACKR1Q16570 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACKR1Q16570 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACKR1Q16570 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ACKR1Q16570 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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