Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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CNGA3Q16281 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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CNGA3Q16281 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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CNGA3Q16281 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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CNGA3Q16281 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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CNGA3Q16281 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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CNGA3Q16281 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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CNGA3Q16281 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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CNGA3Q16281 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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CNGA3Q16281 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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CNGA3Q16281 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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