Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms