Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
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